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【导语】中国科学技术大学生命科学与医学部周丛照教授课题组近日在《美国国家科学院院刊》上发表了一项重要研究成果。该研究利用冷冻电镜单颗粒技术,首次解析了特异性侵染模式鱼腥藻的淡水短尾噬藻体A4的完整三维结构,揭示了其衣壳的双层加固机制及前注射体的原(yuán)位(wèi)组(zǔ)装(zhuāng)模(mó)式(shì),特(tè)别是病毒基因组在前注射体上的包装模式。这一发现为理解短尾噬藻体的侵染机制提供了结构基础,有望推动A4在合成生物学中的应用,对水体富营养化治理具有潜在意义。

中国科学技术大学生命科学与医学部周丛照教授课题组利用冷冻电镜单颗粒技术解析特异性侵染模式鱼腥藻的淡水短尾噬藻体A4的完整三维结构,揭示其衣壳的双层加固机制以及衣壳内部关键侵染元件前注射体的原位组装模式,首次阐明病毒基因组在前注射体上的包装模式,相关研究成果以“Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid”为题于3月31日在线发表在《美国国家科学院院刊》上。
蓝(lán)藻(zǎo)是(shì)淡(dàn)水(shuǐ)生(shēng)态(tài)系(xì)统(tǒng)中(zhōng)重(zhòng)要(yào)的(de)光(guāng)合(hé)微(wēi)生(shēng)物(wù),但(dàn)其(qí)过(guò)度(dù)增(zēng)殖(zhí)将(jiāng)导(dǎo)致(zhì)水(shuǐ)体(tǐ)富(fù)营(yíng)养(yǎng)化(huà),并(bìng)引(yǐn)发(fā)蓝(lán)藻(zǎo)水(shuǐ)华(huá)。噬(shì)藻(zǎo)体(tǐ)作(zuò)为(wèi)蓝(lán)藻(zǎo)的(de)天(tiān)然(rán)“捕(bǔ)食(shí)者(zhě)”,可(kě)裂(liè)解(jiě)宿(sù)主并(bìng)调(diào)控(kòng)蓝(lán)藻(zǎo)的(de)种(zhǒng)群(qún)平(píng)衡(héng),在(zài)水(shuǐ)环(huán)境(jìng)保(bǎo)护(hù)过(guò)程(chéng)中(zhōng)发(fā)挥着重要作用。鱼腥藻PCC 7120是研究淡水蓝藻生理与遗传的模式生物,可被短尾噬藻体A4特异性侵染。短尾噬藻体由于尾长受限,侵染时需要由衣壳内的前注射体(pre-ejectosome)在宿主细胞膜间重构跨膜通道,以辅助病毒完(wán)成(chéng)基(jī)因(yīn)组(zǔ)注(zhù)射(shè)。前(qián)注(zhù)射(shè)体(tǐ)通(tōng)常(cháng)由(yóu)多(duō)个(gè)蛋(dàn)白(bái)高(gāo)度压缩形成,但对其原位构象的研究十分有限,极大地限制对噬藻体基因组包装与侵染机制的深入理解。
作者利用质谱分析鉴定出噬藻体A4的11种结构蛋白,随后通过冷冻电镜技术解析A4的完整三维结构,发现其衣壳由两类不同折叠类型的装饰蛋白(cementprotein)共同加固。其中,主要装饰蛋白gp37以二聚体形式稳定衣壳,而辅助装饰蛋白gp25则以三聚体形式进一步协同加固,形成双层稳定结构(图1)。A4衣壳内部的前注射体(tǐ)由(yóu)四(sì)种(zhǒng)注(zhù)射(shè)蛋(dàn)白(bái)gp29~gp26通过类似“榫卯结构”的方式组装,由内到外形成三层同轴复合体,最终构成五聚体的前注射体。结构分析首次清晰揭示病毒基因组(zǔ)在(zài)前(qián)注(zhù)射(shè)体(tǐ)上(shàng)的(de)包(bāo)装模式:前注射体外侧环绕着七圈双链DNA(dsDNA),其中第一圈dsDNA紧密结合在前注射体最外层gp27-gp26的碱性沟槽中,揭示病毒基因组包装的起始锚定位点。基于前注射体的原位结构并结合前期研究,作者提出短尾噬藻体可能的基因组包装过程和注射机制。该研究首次阐明短尾噬藻体前注射体的精确组装模式,以及其与基因组包装的协同效应,为理解短尾噬藻体的侵染机制提供结构基础,有助于A4作为底盘噬菌体在合成生物学中的应用。
中国科大周丛照教授、李琼副教授和中国科学院水生所张奇亚教授为该(gāi)论(lùn)文的(de)共(gòng)同(tóng)通(tōng)讯(xùn)作(zuò)者(zhě),中(zhōng)国(guó)科(kē)大(dà)博(bó)士(shì)研(yán)究(jiū)生(shēng)侯(hóu)普(pǔ)和(hé)博(bó)士(shì)后(hòu)周(zhōu)睿(ruì)倩(qiàn)为(wèi)该(gāi)论(lùn)文的(de)共(gòng)同(tóng)第(dì)一(yī)作(zuò)者(zhě)。冷(lěng)冻(dòng)电(diàn)镜(jìng)数(shù)据(jù)采集工(gōng)作(zuò)在(zài)中(zhōng)国(guó)科(kē)大(dà)冷(lěng)冻(dòng)电(diàn)镜(jìng)中(zhōng)心(xīn)完成,质谱分析依托生命科学实验中心平台。上述研究得到国家自然科学基金、中央高校基础科研业务费和安徽省科技厅的资助。李琼感谢安徽省青年科技人(rén)才(cái)托(tuō)举(jǔ)计(jì)划(huà)的(de)支(zhī)持(chí)。
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